战国时代
日本战国时代，皇权没落，武士阶级治世，阴阳师逐渐从历史舞台消失。不过，各地大名身边军师的前身大部分仍是阴阳师。
战国大名们都很在意占卦，武将手中的军扇，就是咒术的一种。军扇两面各画有日、月，万一碰到不得不出战的凶日，便在白天把军扇的月亮面显现在表面，让日夜颠倒，以便将凶日化为吉日。
阴阳师们虽然官阶并不高，但却多受权臣贵族的仰仗，其地位远远凌驾于一般官员和武士之上。
江户时代
德川家康开设江户幕府的时候，五行兴替的思想再次被般出来。阴阳道才再次走近政治的中心。
安倍家直系后裔土御门家再次兴旺，嗣子断绝的贺茂家也凭借的支流幸德井家再兴。
但是两家竞争日益白热化，到了江户时代中期，土御门神道终于彻底击败了幸德井家取得了全日本阴阳师的支配权。
阴阳师[奉行阴阳道的术师]
明治时代
明治维新后，出于政治的需要，阴阳道被冠以“淫祠邪教”被明治政府废止，部分内容被以民间信仰的名义残存下来，神道教正式与阴阳道决裂。
阴阳寮
阴阳寮构成：寮头一人、寮助一人、允官一人、大属职一人、小属职一人、阴阳师六人、阴阳博士二人、阴阳生十人、阴阳士一人、皇历博士一人、皇历生十人、天文博士一人、天文生十人、漏刻博士二人、守辰丁二十人、使部二十人、值丁二人。
工作内容主要包括：
1.阴阳道：判断土地凶吉的相地堪舆与占筮。
2.历道：制定日历，决定日子凶吉。
3.天文道：观测天体，卜筮，思考慧星侧隐。
4.漏刻：掌管控制时间。
操纵式神
式神者，式也。
星占里的三式，即式占。
最早的原义是栻盤。一种用来模拟天地运行的木盤。引申出式的概念
阴阳师操控式神是阴阳术师的主要法力技能。
有通过封印函定下契约书的，有通过结印方法降服的，有以朋友关系自愿递交，可以剪纸而成形，只要念出约定的咒语，随时控制召唤出来，连人的魂魄都可以使用，也有以活的生物为凭借做为式神。
《大镜》中记载，晴明将式神当作仆人一样使用，经常吩咐式神倒茶开门。
《宇治拾遗物语》中记载，有一次，晴明因事前往宫中参谒天皇，碰到了藏人少将。这时，一只鸟飞过少将头顶，遗下一滩鸟粪。
见此情形，晴明立刻意识到那只鸟是式神，少将被人施了杀死咒。于是立刻将少将带回自己家中，一整晚都为少将做护身之法。
到了黎明时分，有一人来向晴明坦白，说他找了其他阴阳师，企图咒杀少将，而那位阴阳师施法的式神由于晴明的护身法而不能将少将杀死，反而将自己的主人杀死。
《宇治拾遗物语》中也有关于晴明将纸变成式神的记载。
藤原道长前往法成寺参拜时，随行的一只白狗紧紧咬住他的衣据不让他进门，于是道长请来晴明。
晴明判断有诅咒道长的东西，埋在大门下而。挖开地下五尺有两个素陶杯，用结成十宇形状的黄色纸捻捆扎着，杯底有一个朱砂红宇。
晴明推测施咒的是磨国的道摩法师。于是晴明从怀中掏出一张白纸，把它折成飞鸟的形状，让它嘴边衔着一只酒杯，再抛向空中，白纸顷刻间变成了一只白鹭飞向南方。
白鹭落在一座古宅里，院内坐着一位蓬头垢而、衣冠不整的老法师—道满。
道满坦白是受藤原显光所托施行咒术的。在近代净琉璃中，道满常作为晴明的对手出现。预测地下埋藏物及用纸鸟寻找施咒人都是用来对付施咒术的。
代表人物
观勒僧正
观勒（平假名表记：かんろく，罗马音：KanRoku），百济国的三论宗僧侣，亦通成实宗。推古天皇10年（公元602年）观勒东渡日本，将《元嘉历》、《摩登伽经》等天文、历法、地理、佛教典籍传入日本。两年后（公元604年），观勒带来的《元嘉历》被作为官历采用。除了带来的典籍，观勒还为日本带来了遁甲方术、阴阳五行等思想，可以说是日本阴阳道的先驱者。
他还选拔34名弟子分别授业，其中阳胡玉陈学成历法、大友高聪学成天文遁甲、山背日立学成方术。22年后（公元624年），观勒成为实行僧正僧都制度后的日本的第一任“僧正”，观勒僧正之称也由此而来。
阳胡玉陈
师从观勒僧正，主修历法，在日本被尊为“历道之祖”。
大友高聪
师从观勒僧正，主修相星观天之术，在日本被尊为“天文道之祖”。
山背日立
师从观勒僧正，主修遁甲方术、趋吉避凶之法，在日本被尊为“遁甲方术之祖”。
僧旻
僧旻，百济系保守派的代表人物，在观勒僧正的引荐下出任百济大寺寺司，本来其法名的写法应为“僧日文”，但由于竖向书写造成讹误并被默认下来。推古天皇16年（公元608年）随小野妹子派出的第一回遣隋使至隋，随后在中国待了24年，其间遍学佛学、儒学、阴阳五行、天文、易学诸家。到舒明天皇4年（公元632年），随犬上御田锹派出的第一回遣唐使回国。
回国后僧旻被日本朝廷重用，并将易学引入解释天象和祭祀礼制。
阿倍仲麻吕
奈良时代作为留学生随遣唐使来到大唐，并通过努力学习，成功通过科举，成为了朝中高官。他的中文名为晁衡。后世的安倍晴明自称是阿倍仲麻吕（“阿倍”、“安倍”两个姓氏同源，且在日语中同音）的后裔，但史学界对此存疑。
安倍晴明
日本最有名，影响最大的阴阳师。有关安倍晴明生平事迹，在平安时代后期就已在《大镜》、《今昔物语》中被传述；
在镰仓时代于《宇治拾遗物语》、《古今着闻集》、《平家物语》、《源平盛衰记》当中出现。到了江户时代，更有《晴明物语》、《芦屋道满大内鉴》等书记载他的轶闻。另外像是人形净琉璃、歌舞伎、落语等戏曲也经常使用安倍晴明的传奇故事作为题材。时至今日，甚至还有「安倍晴明研究会」。
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