二十六日，早朝。
秘书丞令狐德棻上书说：“陛下，魏晋南北朝以来，天下久经战乱，经典书籍散失颇多，宫中资料残缺，请陛下收购征集流散在各地的书籍资料，设立机构任命官吏整理补录。”
李渊听后觉得有理，于是命令狐德棻、陈叔达、裴世矩、赵弘智、袁朗、欧阳询等人编修《艺文类聚》。此书至武德七年，编修完成，是中国现存最早的一部完整的官修类书，它保存了中国唐代以前丰富的文献资料，尤其是许多诗文歌赋等文学作品。全书共一百卷，一百万余字，征引古籍一千四百三十一种。与《北堂书钞》、《初学记》、《白氏六帖》合称“唐代四大类书”。
令狐德棻又说：“最近几个朝代没有编纂正式历史，梁、陈、北齐的文史资料还可做依据，至于北周、隋朝的史事记录大多脱漏缺损。如今还有耳闻目睹的人在，编纂史书可做依据；一旦时过境迁，事情都模糊不清，就无法收集了。陛下从隋朝接过帝位，隋朝继承北周的帝位，两代皇祖的功业多半建立在北周，如果不评议次第，各编一部正史，那么祖先的业绩、历代的功劳不能发扬光大，后世就不能流传了。”
李渊深以为然，立即下诏说：“史官负责记载历史，考察评论得失，深入探究历史的变通之处，以此来区分事物的类别，惩恶劝善，让人们多了解古代的历史，为将来的治理提供借鉴。从伏羲氏以来，历经周秦，直到两汉，历史传承不断，三国并立，一直到晋宋，各种典籍都齐备了。自从魏国南迁以来，各个朝代乘机而起，统治天下，周隋之间禅位交替，历代相承。梁朝自称国家，横跨淮海地区；齐国迁都，建立宗庙社稷；陈朝也建立政权。这些朝代都各自称正朔，历经多年，使用着不同的年号，制定礼仪制度。至于开国奠基、皇位更迭、好的谋略和政策、著名的臣子和杰出的人才，以及他们的言论和功绩，在当时都不乏其人。然而，这些事迹都没有被编纂成典籍，纪传体史书也都缺失。随着时间的推移，世俗的传说逐渐变迁、失真，那些过去的辉煌事迹和优良传统都快要消失了。朕手握图籍，统治天下，希望建立长久的统治，养育百姓。现在朕正要制定法典和谟训，让它们永远流传下去。看到那些被埋没的历史，朕深感痛心，并怀有修史的志向。要修撰这些历史，确实需要正直而有才能的人。
朕经过再三思量，决定命中书令萧瑀、给事中王敬业、著作郎殷闻礼负责修撰《魏史》；侍中陈叔达、秘书丞令狐德棻、太史庾俭负责修撰《周史》；中书令封德彝、中书舍人颜师古负责修撰《隋史》；大理卿崔善为、中书舍人孔绍安、太子冼马萧德言负责修撰《梁史》；太子詹事裴世矩、兼吏部郎中祖孝孙、太子冼马魏征负责修撰《齐史》；秘书监窦琎、给事中欧阳询、秦王文学姚思廉负责修撰《陈史》。你们一定要详细审慎地修撰，广泛搜集旧有的文献资料，对于正确的义理要保留下来，不要改动，修史的笔法要公正，不要隐瞒事实。”
群臣皆交口称颂。
二十七日，李渊修国书于高句丽王，请求高句丽王放因隋末战乱而逃生至高句丽的百姓回国发展生产。
十二月底，数以万计的百姓回归乡土，李渊命各州县长官好生抚慰，尽快使百姓恢复生产。
武德六年正月初五，刘黑闼率残兵逃往饶阳，秉钺将军刘弘基率兵一路追击。刘黑闼部饶州刺史诸葛德威放刘黑闼入城，刘黑闼等人一进城，便被设计捉住，而后举城投降，并将刘黑闼、刘十善、苏定方等绑缚至李建成处，请李建成发落。
李建成欲将贼众全部斩首，魏征劝说：“万万不可再开杀戮！难道窦建德的教训还不够深刻？”
“魏征，你这是何意？”李建成问。
“太子殿下，山东、河北久经战乱、人心思归，处死所有人必将引起山东、河北人民更大的反抗，他们会想朝廷为何对其他匪首如此宽容，而对山东、河北的匪首如此痛恨？如今，太子殿下当仁义为怀，少开杀戒，只对刘黑闼斩首即可，对其他从犯不如让其归乡。”
“你是河北人？”
“正因为臣是河北人，所以了解河北人的心思，河北人民自古好战，战争对他们来说，不可怕，而怀柔政策才是对河北人们最大的杀手锏，想当年袁绍兵败，曹操在河北与民休息、发展生产，后来河北成了曹操稳固的后方，最终为三足鼎立积累了重大的政治和经济资本。河北，世家大族很多，他们深受儒家思想影响，释放河北士兵，有利于拉拢世家大族的人心，这才是最重要的，况且，秦王为陕东道大行台，潼关以东尽在其手，我们若善待河北士卒，那么将来他们必定感念您的恩情，这也将成为您对抗秦王的最大资本啊！”
魏征的一席话令李建成茅塞顿开，于是，下令除刘黑闼外，全部释放。
程名振对太子说：“太子殿下，刘黑闼杀我全家，请让我砍掉他的首级，以告慰臣母亲和妻子的在天之灵！”
李建成准奏，下令由程名振执行死刑，临刑前刘黑闼叹息道：“我有幸在家种菜，却被高雅贤这些人害得落到如此下场！”
至此，刘黑闼作乱彻底终结，李世民、李元吉、李建成兄弟三人都曾作为主帅讨伐刘黑闼，然而三人采用的方法却截然不同，李世民杀伐果断，以武力平定刘黑闼，但是，武力只能攻城，不能攻心；李元吉则空有主帅之名，不尽主帅之责；李建成则听从魏征、王珪等人的建议，攻心为上，所以最终覆灭了刘黑闼。无论从过程还是从结果来看，李建成平定刘黑闼无疑是最成功的，大唐付出的代价也是最小的。
刘黑闼被平定后，李渊征调李艺入朝，并任命李艺为左翊卫大将军，庐江王李瑗接替李艺任幽州大都督。李艺明白，如果自己不入朝，李渊一定不会安心，李艺为了自己的安全，也为了交好李建成，从而为自己的未来找到光明的前途，他只能入朝，也必须入朝。从此，李艺与李建成交往越来越密切，李艺也将自己更大的政治资本押向了李建成。
二月十二日，平阳公主去世，李渊谥为“昭”，后世称其为平阳昭公主。
是日，李渊着礼部议平阳昭公主葬礼。李渊说：“隋末以来，三女招兵买马，从朕起兵，攻长安、守苇泽关（相传因平阳昭公主而后得名娘子关），智勇双全、胆略过人，真可谓巾帼不让须眉。今早薨，朕决议以军礼葬之！”
礼部和太常寺官员极力反对，称女子以军礼下葬者，闻所未闻，这不合礼制。
李渊反驳说：“平阳公主战功赫赫，此等奇女子，古之未有，以军礼下葬，有何不可？”
礼部和太常寺官员羞愧难当、无言以对。
李渊下令，前后部鼓吹乐、持班剑的仪仗队四十人以及武装勇士卫护送灵。
二十日，徐圆朗见形势不妙，弃城逃跑，后为乡里百姓擒获处死。至此，大唐境内反叛者仅剩高开道一部。
三月初七，高开道掠夺文安、鲁城，被唐军打败。
二十一日，吐谷浑侵犯洮、岷二州，李渊命岐州刺史柴绍前往救援。
二十三日，苑君璋率突厥军队侵犯马邑，右武侯大将军李高迁及高满政于腊河谷击败苑君璋。李渊大喜，任命高满政为朔州总管、荣国公。
二十九日，柴绍与吐谷浑作战，被吐谷浑包围，敌军居高临下，箭射唐军。柴绍不慌不忙，命人弹奏琵琶，敌军不解，纷纷放下防备，突然，柴绍命唐军骑兵绕到敌军背后，杀吐谷浑一个措手不及，吐谷浑退却。
二十四日，梁师都的将领贺遂、索同以所管辖的十二个州降唐。
二十七日，李伏威心腹茂德府别将戴义告知辅公祏有谋反之心，李伏威惶恐，当日，惊惧而死，时年四十一岁。
二十八日，李渊下令以人的初生为“黄”，四岁为“小”，十六岁为“中”，二十一岁为“丁”，六十岁为“老”。又下令让天下各户根据自己的资产情况，被划分为三个等级，每年编造一次账册，每三年编造一次户籍。州县保留五份户籍比对，尚书省保留三份。
大唐的户籍制度，从此刻正式开始。
二十九日，盗匪出身的洪州总管张善安反叛，大唐内乱又起，李渊派舒州总管张镇周等人攻打张善安。
不久，张善安攻陷孙州，捉住总管王戎。
七月十二日，岁星侵犯了毕宿。傅奕认为这预示着边疆将有战事。
十九日，荧惑星侵犯了舆鬼星的西南星。傅奕认为这预示着大臣会被诛杀。
八月初九，在左游仙游说下，李伏威部辅公祏举兵反叛，他打着为李伏威报仇的旗号，命人伪造了李伏威起兵手诏，声称王雄诞有二心，王雄诞听后称病不出家门，辅公祏趁机夺了其兵权，失去兵权后，辅公祏派人抓捕王雄诞，命人缢死。
王雄诞乃李伏威部下第一猛将，深谙兵法，但是在政治上却远远不及辅公祏，可怜一代名将，最终落得如此下场。后来，李世民即位后，诏赠其为左骁卫大将军、越州都督，谥号为“忠”。
而后，辅公祏假拖吴王遗命，在丹阳称帝建国，与张善安联合，并以张善安为西南道大行台。
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