初五，李渊下《立秦王为太子诏》说：“储君之位，关系国家根本，必须选择品德高尚、才能出众之人，以安定天下。天策上将、太尉、尚书令、陕东道大行台尚书令、益州道行台尚书令、雍蒲二州都督、领十二卫大将军、中书令、上柱国秦王李世民，品质高远，风范卓越，早有宏图大志，功业日益显赫。孝是德行的根本，体现在各种行为之中；仁是治理国家的重任，能够安抚万物。秦王自创业之初，便经营四方，平定诸多战乱，征讨叛逆，屡建奇功，制定政策，造福百姓，功勋卓著，道德高尚，堪当大任。因此，应顺应天命，立秦王李世民为皇太子。”
然后又下《令皇太子断决机务诏》说：“朕统治天下，勤勉处理各种政务，天不亮就起床穿衣，思考如何弘扬至善之道。然而政务繁多复杂，需要处理的事务堆积如山，从早到晚坐在皇位上，实在疲惫于批阅奏章和听取汇报。皇太子李世民，天生聪慧，有见识，度量宏大，明理公允，兼具文化和武功，平定了天下。九卿的职位得到合理安排，四方的门户因此和睦。朕托付得当，人选合适，感觉如同卸下了重担，远近都安宁太平，对此朕深感欣慰。从今以后，军机、兵器、粮食以及所有政务，无论大小，都委托给皇太子决断，然后再向朕奏报。既然这是普天同庆的大事，应该施加恩惠。那些继承父亲爵位的人，如果有封爵，都可以继承；那些已经拟定用赤牒授予官职的人，现任的立即转为正式官职，已经离职的，在参加选拔时，可以按照官阶次序叙任；失去官职和爵位的人，酌情提拔任用；拖欠的租税和先前欠官府的钱财物品，全部免除。文武官员，按等级赏赐，务必做到优待，以符合朕的心意。”
同日，冯立、谢叔方、太子右卫率府铠曹参军唐临回京请罪。
李世民诘问冯立，说：“你在东宫，挑唆我和太子关系，使太子对我心生嫌隙，最终闹得手足相残，你可知罪？昨天太子已死，你仍派兵攻打玄武门，杀我将士，你可知罪？”
冯立回答说：“我受恩于太子，理应为太子谋划，只求舍命报效，为主尽忠，何罪之有？”
李世民大喜，扶起冯立，说：“真是忠义之士！”
于是，派人送上绸缎、黄金，以示慰勉。
李世民又对谢叔方说：“当初晋阳起兵，你就是功臣，望今后您能再续新功！”
谢叔方感动地跪倒于地。李世民同样赏赐了他。
李世民又对唐临说：“唐皎是你哥哥吧？”
唐临回复说：“正是！”
李世民又说：“你的哥哥在秦王府一直尽职尽责，深受我的喜欢，你既然是他的弟弟，那朕看在他的面子上，宽恕你的罪过，而且我打算让你做万泉县丞，你可愿意？”
唐临立即跪下谢恩说：“臣感谢太子殿下信任，不过，臣希望太子殿下不是看在我哥哥的面子上饶恕我的罪过，并且授予我官职，而是希望太子殿下是因为赦免诏书而宽恕我的罪过。”
李世民听完，立即改口说：“你说得对！”
李世民不仅没对太子和齐王旧党进行清算，反而好言抚慰，使得不少太子党、齐王党人员陆续出来。
“尉迟敬德，你替我去请薛万彻！”李世民对尉迟敬德说。
“我去？这不合适！玄武门前他恨不得杀了我，要是我去，准打起来了！”尉迟敬德急忙拒绝。
“殿下，有一个人去请最为合适。”房玄龄说。
“何人？”李世民问。
“李靖！”
听到李靖的名字，李世民点了点头，说：“以李靖的威望，薛万彻至少不会不见！”
于是派李靖前去说服薛万彻。
李靖来到薛万彻处，薛万彻却躲了起来，李靖闯入房间，大声地说：“可惜啊，我带了上好的酒，却没人能和我对饮！”
听到李靖说带了好酒，薛万彻立刻现身，说：“不知李靖兄造访，有失远迎，望乞恕罪！”
李靖说：“老弟啊，我们是武将，要的是驰骋沙场、建功立业，何必要参与皇室内部的争斗呢？你糊涂啊！”
“可太子对我有恩！”
“我知道，但你愿意将自己一身本领埋没于这终南山中吗？跟你说实话吧，新太子赏识你，派我寻你回去，你若信得过老夫，就跟我走，我以性命担保，新太子不会难为你，老夫的话你不会不信吧？”
看到薛万彻还有些犹豫，李靖又说：“随我驰骋大漠戈壁去不好吗？”
“好！我跟你走！”
薛万彻经过李靖劝说，终于答应复出辅佐李世民，并担任为太子宫副护军。
与此同时，益州大都督窦轨因与韦云起、郭行方关系一向不和睦，韦云起的弟弟韦庆俭以及宗族多数是李建成一党，窦轨便想趁机将韦、郭二人除掉。不久，赦免诏书下达益州，窦轨将诏书藏于怀中，韦云起询问说：“赦免诏书何在？”窦轨不肯给他看，反而说：“你想谋反吗！”于是将韦云起逮捕杀害。郭行方恐惧逃奔京城，求见李世民，最终得以幸免。
李世民听完郭行方的叙述，写信给窦轨说：“朕已经决定赦免李建成余党，你为何挟私不遵王道？”
魏征府上，魏征呆呆坐在地上，口中喃喃：“就差一天，就差一天结果就会不一样！”
突然，魏征站起身，对妻子说：“你说这个新太子也不算昏庸吧？平王世充、灭窦建德之后，力主不杀窦建德，还遣散了窦建德的士兵，放其归田种地，安抚河北百姓，这都算是明君之举吧？还有，太子、齐王伏诛后，他并没有对太子党、齐王党赶尽杀绝，这应该算是仁君吧？”
魏征妻子说：“可是你曾经主张谋杀他，他会放过你吗？”
“我想应该不会吧！毕竟这种事情我想换了谁也不会如此宽容大度！”
魏征妻子听后，急忙说：“那你快去求房玄龄，他和你是同窗，又是新太子身边的红人，他要是愿意出面保你，也许你还有一线生机！”
“去求他？算了吧！我宁愿死！”
“你啊，真是的！你说你当初为什么要献毒计给太子？”
“我是太子冼马，辅佐太子天经地义，我自然要为太子考虑，这是我分内之事啊！”
“魏征，我们跑吧！”
“跑？普天之下，莫非王土，大唐统一了天下，我们还能往哪跑？现在，我们恐怕连长安都出不去了！”
“那怎么办？难道我们就只能等死了吗？”
“事到如今，别无他法了！”
“横竖都是一死，我们出去跟他们拼了！”魏征妻子说完，拎起菜刀向外出去。
魏征见状，不敢阻拦。
“魏征，外面一个人没有！”魏征妻子回来说。
“一个人都没有？”魏征问。
“真是一个人没有！奇怪啊！按理说，你是太子冼马，算是从犯中的首犯了，为什么新太子不派兵包围这里，或是把我们抓起来？”魏征妻子诧异地说。
“这才最可怕！看来新太子想让我恐惧几天，然后再慢慢折磨我！”
“唉！跟对了人，跟错了人，真是不一样啊！”魏征妻子感叹说。
“谁跟错了人？太子也不差啊！”魏征大声吼了起来。
“你吼什么吼！死鸭子嘴硬，你跟对了人，房玄龄跟错了人，行了吧？可是现在人家是新太子的座上宾，你是旧太子的殉葬者，都快死了还不承认自己跟错了人！”
“我······我就不承认我跟错了人！”魏征小声地嘀咕。
“没话可说了吧！”魏征妻子调侃着说。
“依我看，我们就跑吧！大不了被抓住，反而死得痛快！”魏征妻子接着说。
魏征听了妻子话，沉思半晌，说：“该来的总会来，我现在就去找新太子，要杀要剐遂了他的心，没准他大人有大量，向对待冯立他们那样对我。”
打定主意的魏征立即让妻子取来笔墨纸砚，写下了很多治国方略，然后交给了妻子。
魏征妻子问：“人都要死了，写这些有什么用？”
魏征说：“人过留名，雁过留声，临死前，为天下再做一点贡献吧，也不枉活了一世！”说罢，让妻子藏好，并嘱咐如果自己身死，找机会送给李世民。
魏征妻子泣不成声，说：“魏征，你永远那么迂腐！”
魏征站起身，头也不回地向门外走去。
见到李世民后，魏征跪地，说：“魏征参见太子殿下。”
李世民看着跪在眼前的魏征，说：“魏征，你以前拜见太子，现在又拜见太子，我曾读过一点《论语》，论语中提到曾子说‘吾日三省吾身，为人谋而不忠乎？’，我想问你是忠还是不忠啊？”
房玄龄、长孙无忌、尉迟敬德等人大笑。
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