从此，李世民带领各卫将士在显德殿庭院练习箭术，并当面训话道：“自古以来，中原饱受戎狄之苦，而中原的君主大多安逸享乐，觉得只要拿出金银就能免除灾祸，他们不修武备，一旦战争来临，将士丢盔弃甲，君主也弃太庙社稷于不顾，狼狈逃命，西周如此，西晋亦如此，这都是血淋淋的教训啊！朕是靠马上得的天下，最重武备，朕绝不允许朕从马上失天下，现在突厥猖獗，我们还没有把握战胜他们，不过，朕相信，只要我们团结一心，我们一定能战胜突厥！朕不让你们为朕修宫殿，朕要让你们练习射箭技术，射得好，朕有赏，士兵可能会升为将军，将军也会得到金银布帛的赏赐，射得不好，朕要罚，而且不仅你们要罚，你们的将军朕也要罚，士兵的无能就是将军的无能！朕会经常来看你们，甚至亲手教你们，朕还要亲自主持考试，都记住了吗？”
“是！”各卫将士齐声答道。
众大臣劝道：“陛下，依照大唐律令，在皇帝身边手持刀刃要判死刑，如今，陛下不仅允许他们在您身边张弓搭箭，而且还亲自教他们射箭，万一有什么闪失，社稷倾覆啊！”
李世民说：“他们都是朕身边的人，朕难道还不能相信他们吗？凡我大唐子民，均是朕的子嗣，朕怎么能疑心自己的子嗣吗？”
众人不再劝谏。
李世民继续说：“朕如果有空会亲自教你们射箭，朕不在的时候，由张士贵将军带领你们练习射箭，张士贵将军可是除了朕之外，射术最好的，你们一定要认真学习！”
不久，李世民观看禁军演练，发现士兵队列不整，于是批评了张士贵，并责令他杖责几个负责教练的小教官。张士贵因爱护部将，杖责时并不真打，只是点到为止。李世民看到后认为张士贵在违抗圣旨，要处罚他。
魏征进谏说：“教官未尽到责任，应送大理寺依法惩处，罪责不在张大将军，再说让张将军为一件小事而杖责部将，他不忍心下手也是情理之中的事，为此而处罚皇上的心腹、身居要职的张大将军，是不合适的。”
李世民觉得魏征所言在理，于是免除了对张士贵的处罚。
二十四日，李世民与群臣当面议定开国元勋长孙无忌等人的爵位田邑，命陈叔达在宫殿下唱名公布。李世民说：“朕分等级排列你们的功劳赏赐，如有不当之处，可以各自申明。”
陈叔达立于殿中，奉诏说：“褒贤昭德，昔王令典，旌善念功，有国彝训。吏部尚书上党县公长孙无忌、中书令临淄县侯房元龄、右武侯大将军尉迟敬德、兵部尚书建平县男杜如晦、左卫将军全椒县子侯君集等，或夙预谟谋、绸缪帷幄、竭心倾恳、备申忠益；或早从任使、契阔戎麾、诚着艰难、绩宣内外、义冠终始、志坚金石、誓以山河，实允朝议。长孙无忌封齐国公，房元龄封邢国公，尉迟敬德封鄂国公，杜如晦封莱国公，侯君集封潞国公。至于食邑，着侍中、中书令、左右仆射商议！”
淮安王李神通出班奏曰：“臣不服！当年太上皇义旗初举，臣率兵积极响应，今长孙无忌、房玄龄、杜如晦等人本是刀笔小吏，其荣怎可在我之上？”
李世民大声呵斥，说：“皇叔举义旗无非是为了保命，然起兵之后，皇叔屡战屡败，窦建德发兵时，你全军覆没，刘黑闼起兵后，你望风而逃，然房玄龄、杜如晦、长孙无忌等运筹帷幄，有社稷之功，他们就像朕的萧何、张良，因此功为一等。你虽然是皇室宗亲，但朕却不能徇私！”
李神通无话可说，其他人见状也不敢多说，纷纷称赞李世民处事公道。
待所有等级功臣都宣布完毕后，房玄龄小声对李世民说：“陛下，原秦王府僚属跟随陛下建功立业，却有很多人却位在前太子和齐王的僚属之下，他们都心有不满啊！”
李世民说：“君主应大公无私，才能使天下人心服。百官俸禄皆来自百姓奉养，朕选官任官自然要以百姓为念，怎么能因为亲疏远近而令百姓失望呢？昔管仲是公子纠的人，然齐桓公不念旧恶，反而任为相国，在管仲的辅佐下，齐桓公终成霸主，如果齐桓公也按照亲疏远近来安排官职，恐怕难成霸主之基业吧！”
房玄龄愧而退之。
听到房玄龄张口闭口原秦王府、前太子府，李世民意识到，很多人的思想还没有转变，他们还认为原秦王府的人高人一等，如此下去，两派何时才能彻底和解？
李世民心怀忧虑的回到后宫，见到皇后，将苦恼说了出来，让皇后想个主意。
皇后说：“我一介女流，舔为皇后，管理这后宫已是不易，前朝的事我怎么能管？”
“皇后，此事我不跟你说，我能和谁说？现在臣子除了原太子府的人就是原秦王府的人，我能跟他们说吗？”
“陛下，您错了，还有太上皇的人呢？”长孙无忌提醒道。
“对啊！无论秦王府还是太子府，都有一个共同的敌人，那就是太上皇！”李世民恍然大悟。
“陛下又错了，您既然想与天下人和解，那就不能仅和前太子的人和解，难道太上皇的人就不是天下人？您刚即位，很多事情都需要老臣帮助，您要想办法让所有人都能化干戈为玉帛！”
“那有什么好办法呢？”
“这个是你需要解决的，不是我需要解决的，如果后宫出现这种情况，我就会让各妃子整天聚到一起，很多时候，他们之间互相讨厌只是因为他们有共同的竞争目标，而当他们长久相处后，彼此互相了解、信任，也许事情就会改变呢？韩信拜大将军时，没有人服他，可当他带兵打了胜仗后，了解了他的本事，所有人都佩服不已。”
听了皇后一番话，李世民大呼：“我明白了！”
第二天，李世民设置弘文馆，既是国家藏书之所，也是皇帝招纳文学之士之地，他将虞世南、欧阳询、褚亮、姚思廉、蔡允恭、萧德言、陆德明、孔颖达等英才聚集在一起，日夜修书订典、讲论经义，经常至半夜才肯罢休。渐渐地，众人的心开始慢慢聚拢到一起。
十月初一，日食再次出现在氐宿的七度位置。太卜认为这是可能发生政权动荡的征兆。
次日，群臣对李世民说：“陛下，前太子、齐王已死多日，按制需要有谥号，然太上皇已将二人贬为庶人，不知我们如何记述二人？”
李世民说：“虽然齐王、前太子谋反，但毕竟是朕的骨肉兄弟，既然人都已经死了，一切恩怨就应该一笔勾销了，朕想恢复二人的宗籍，并把朕的儿子过继给前太子和齐王，以慰二人无子嗣之遗憾，既然二人恢复了宗籍，理应给予爵位和谥号，众爱卿就议一议吧！”
礼部侍郎说：“臣请谥前太子为戾！”
李世民问：“戾是什么意思？”
礼部侍郎说：“不悔前过为戾，不思顺受为戾，知过不改为戾。”
李世民听后，摇摇头说：“这个不好，换一个！”
礼部侍郎说：“那就谥号为灵吧！”
李世民又问：“灵是什么意思？”
礼部侍郎答：“不勤成名曰灵，死而志成曰灵，死见神能曰灵，乱而不损曰灵，好祭鬼怪曰灵，极知鬼神曰灵。”
李世民听后，没有同意也没有拒绝。
礼部侍郎又说：“臣请追封故太子建成为息王，谥曰灵；齐王李元吉为海陵王，谥曰剌。”
李世民听后，说：“朕仍觉得不妥，此事以后再议吧！”
后直到贞观二年二人才最终依礼下葬，李建成谥号定为灵，封号为息王，下葬以后，又将灵改为隐，李元吉谥号定为剌，封号为海陵郡王，贞观十六年，改封号为巢。
十月初八，尚书八座奏请立储君。李世民下诏说：“尚书们的奏议认为，太子是国家未来的希望，必须虔诚地奉守宗庙，稳固国家。中山王李承乾，身为嫡长子，天资聪颖，仁孝纯厚，学业有成，早就展现出卓越的才智和学识。他符合立为太子的条件，应培养他的德行，以继承皇位。朕恭敬地继承先祖的基业，位居皇位，遵循先帝的遗志，弘扬正道。因此，应依从众臣的请求，立李承乾为皇太子。”
于是，李承乾正式被册封为皇太子，时年仅八岁。
十八日，经侍中、中书令、左右仆射等商议，最终将功臣食邑确定，并报李世民批准。
李世民看后，即刻批准，诏令群臣，说：“裴寂食邑一千五百户，长孙无忌、王君廓、尉迟敬德、房玄龄、杜如晦食邑一千三百户，长孙顺德、柴绍、燕郡王李艺、赵郡王李孝恭食邑一千二百户，侯君集、张公谨、刘师立食邑一千户，李世绩、刘弘基食邑九百户，高士廉、宇文士及、秦叔宝、程知节食邑七百户，安兴贵、安修仁、唐俭、窦轨、屈突通、萧瑀、封德彝、刘义节食邑六百户，钱九陇、樊世兴、公孙武达、李孟常、段志玄、庞卿恽、张亮、李药师、杜淹、元仲文食邑四百户，张长逊、张平高、李安远、李子和、秦行师、马三宝食邑三百户。”
其中，李艺又被李世民授予开府仪同三司这种文散官，李世民的封赏对于其他人来说那是恩赐，而在李艺看来，自己因为是李建成的死党，如今却被封为开府仪同三司，这无疑传递了一个危险的信号，那就是李世民要准备夺取自己的兵权了。
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